| Final | ||||
| 5/9/2103 | SHB Đà Nẵng | 1 v 1 | XM The Vissai Ninh Bình | |
| 5-6 Pens | ||||
| Semi finals | ||||
| 8/8/2013 | Đồng Tâm Long An | 3 v 3 | XM The Vissai Ninh Bình | 3-4 Pens |
| Đồng Nai | 4 v 4 | SHB Đà Nẵng | 3-4 Pens | |
| Quarter finals | ||||
| 11/7/2103 | Đồng Tâm Long An | 2 v 1 | Hà Nội T&T | |
| SHB Đà Nẵng | 3 v 0 | QNK Quảng Nam | ||
| 10/7/2013 | XM The Vissai Ninh Bình | 2 v 1 | Hoàng Anh Gia Lai | |
| Thanh Hóa | 0 v 1 | Đồng Nai | ||
| Round 1/8 | ||||
| 26/03/2013 | XM The Vissai Ninh Bình | 2 v 1 | Than Quảng Ninh | |
| Thanh Hóa | 0 v 0 | Sông Lam Nghệ An | 4-2 Pens | |
| Hùng Vương An Giang | 1 v 5 | Đồng Tâm Long An | ||
| Đồng Nai | 3 v 1 | Bình Định FC | ||
| 25/03/2013 | SHB Đà Nẵng | 3 v 2 | Becamex Bình Dương | |
| Hoàng Anh Gia Lai | 2 v 1 | XM Xuân Thành Sài Gòn | ||
| Hà Nội T&T | 3 v 3 | Kienlongbank Kiên Giang | ||
| 24/03/2013 | QNK Quảng Nam | 1 v 0 | XM Vicem Hải Phòng | |
| Qualifying | ||||
| 16/03/2013 | Hùng Vương An Giang | 4 v 0 | XSKT Cần Thơ | |
| TĐCS Đồng Tháp | 0 v 0 | QNK Quảng Nam | 2-4 Pens | |